Commit 1ea276d5 authored by Matthieu Boileau's avatar Matthieu Boileau
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Update présentation du groupe Calcul (#64)

Regroupement au sein d'une seule page.
parent 6a6a905d
......@@ -161,7 +161,7 @@ ANF Réduction de la |_| dimension dans la fouille de |_| données massives |_|
.. image:: attachments/spip/IMG/jpg/oleron.jpg
:scale: 50 %
:alt: alternate text
:alt: Photo aérienne du village vacances
:align: right
.. section:: Modalités
......
Bureau du |_| groupe calcul
###########################
:date: 2019-03-13
:modified: 2019-03-13
:slug: membres_bureau
.. contents::
.. section:: Membres
:class: orga
- Matthieu Boileau
- Anne Cadiou
- Cécile Cavet
- Roland Denis
- Thierry Dumont
- Bernard Dussoubs
- Benoit Fabrèges
- Sylvain Faure
- Alain Franc
- Loïc Gouarin
- Matthieu Haefele
- Florent Langrognet
- Violaine Louvet
- Marco Mancini
- Pierre Navaro
- Fabrice Roy
- Laurent Series
......@@ -19,7 +19,7 @@ Mentions légales
- Loïc Gouarin
- Matthieu Haefele
Rédacteurs en chef et relecteurs : `bureau du Groupe Calcul <{filename}membres_bureau.rst>`_
Rédacteurs en chef et relecteurs : `bureau du Groupe Calcul <{filename}presentation_groupe.rst#bureau>`_
.. section:: Hébergement et contact
......@@ -102,6 +102,28 @@ Mentions légales
des protocoles sécurisés.
.. section:: Formulaires d'inscription sur Indico
:class: description
Quatre catégories de personnes sont concernées par ces données :
- les participants,
- les organisateurs,
- les intervenants,
- les prestataires missionnés par les organisateurs.
Les destinataires des données sont principalement les organisateurs, éventuellement les intervenants (sondage
pré-formation, par exemple) et au besoin les prestataires (dans le cas d'un hébergement hôtelier, par exemple).
Les données seront conservées sur le serveur Indico qui les héberge tant que les personnes concernées n'en
demandent pas la suppresssion.
L'accès aux données se fait depuis les comptes d'administration de l'évènement Indico via le protocole https et
après authentification par mot de passe.
.. section:: Formulaire de publication d'une offre d'emploi
:class: description
TODO
.. section:: Vos droits
:class: description
......
Présentation du |_| Groupement de |_| Recherche
###############################################
:date: 2019-03-13
:modified: 2019-03-13
:slug: presentation_gdr
.. contents::
.. section:: TODO
:class: description
To Cut & paste
......@@ -14,43 +14,114 @@ Présentation du |_| groupe calcul
Le groupe Calcul est un groupe de communications et d’échanges de la communauté du calcul en France.
Il a pour vocation d’être un réseau métier pour la communauté du calcul.
Depuis 2009, ce groupe s’est structuré en un `GDR <presentation_gdr.html>`_ et un `réseau métier <presentation_reseau.html>`_, et continue à oeuvrer pour la communauté.
Depuis 2009, ce groupe s’est structuré en un
`Groupement de Recherche <{filename}presentation_groupe.rst#le-groupement-de-recherche>`_ (GDR) et un
`réseau métier <{filename}presentation_groupe.rst#le-reseau>`_, et continue à oeuvrer pour la communauté par le
biais d'actions telles que :
Ces actions sont diverses :
- l'animation de listes de discussion
- l'organisation de journées scientifiques et techniques
- la participation à des manifestations scientifiques et techniques
- le `soutien aux actions des mésocentres <mesocentres_en_france.html>`_
- liste de discussion
- organisation de journées techniques
- Participation à des manifestations scientifiques et techniques
- `Soutien aux actions des méso-centres <mesocentres_en_france.html>`_
Le Groupe Calcul est en interaction permanente avec ses
`tutelles et partenaires institutionnels <{filename}presentation_groupe.rst#structuration-institutionnelle-et-pilotage>`_ .
.. figure:: ../attachments/img/hexagones.png
:width: 500 px
:scale: 100 %
:alt: Image situant le réseau et le GdR au croisement des disciplines et en interaction avec ses partenaires
:align: center
Le Groupe Calcul à la croisée des thématiques en interaction avec ses partenaires.
Le Groupe Calcul interagit de façon importante avec un certain nombre de partenaires.
.. section:: Objectifs
:class: description
- Organiser et encourager la mise en place de rencontres scientifiques, d’actions de formation, aider aux développements des compétences, faciliter le transfert de connaissances à la fois scientifiques et techniques.
- Organiser et encourager la mise en place de rencontres scientifiques, d’actions de formation, aider aux
développements des compétences, faciliter le transfert de connaissances à la fois scientifiques et techniques.
- Développer, faciliter et encourager la communication entre les divers acteurs français du calcul.
- Promouvoir et contribuer à l’émergence d’une communauté dans le paysage scientifique français du calcul. Appréhender le fonctionnement des communautés équivalentes en Europe et dans le reste du monde.
- Favoriser l’émergence d’une communauté dans le paysage scientifique du calcul en France. Faire le lien avec les
communautés équivalentes en Europe et dans le reste du monde.
.. section:: Actions
:class: description
- Organisation de journées et formations techniques et scientifiques
- Animation, diffusion d’informations via la liste de discussion pour impulser et encourager les échanges, fédérer les compétences de tous et favoriser la circulation des idées :
- Animation, diffusion d’informations via la liste de discussion pour impulser et encourager les échanges, fédérer
les compétences de tous et favoriser la circulation des idées.
Les discussions relèvent de trois catégories principales :
- Echanges techniques
- Annonces de séminaires et de formations
- Offres d’emploi
- échanges techniques
- annonces de séminaires et de formations
- offres d’emploi
- Maintenance d'un site web avec l'ensemble des journées et formations organisées jusque là, les programmes et supports de formation
- ??? Valorisation de l’activité de développement au sein des laboratoires de recherche en collaboration avec le projet Plume/Relier ???.
- Gestion d'un site web publiant l'ensemble des journées et formations organisées par le groupe Calcul.
Le site héberge les programmes des évènements et sert d'archive pour les supports de présentation et de formation.
.. section:: Structuration institutionnelle et pilotage
.. section:: Structuration et pilotage
:class: description
Groupe Calcul a été créé en 2003. Depuis 2009, il s’est structuré afin d’améliorer sa visibilité et ses moyens d’action. Cette structuration prend en compte la diversité intrinsèque de calcul :
Le groupe Calcul a été créé en 2003.
En 2009, il s’est structuré afin d’améliorer sa visibilité et ses moyens d’action.
Cette structuration reflète la diversité des thèmes scientifiques et techniques du calcul :
- Création d’un `Groupement De Recherche (GdR 3275) <{filename}presentation_groupe.rst#le-groupement-de-recherche>`_
du CNRS rattaché à l'`INSMI <https://www.cnrs.fr/insmi/>`_ pour les aspects scientifiques du calcul (mathématiques
appliquées et recherche en informatique),
- Création d’un `réseau métier <{filename}presentation_groupe.rst#le-reseau>`_ rattaché à la `Mission pour les Initiatives
Transverses et Interdisciplinaires (MITI) <http://www.cnrs.fr/mi>`_ du CNRS pour les aspects technologiques
(programmation, optimisation, architectures, etc.),
- Partenariat avec `Grand Équipement National de Calcul Intensif (GENCI) <http://www.genci.fr/fr>`_ sur les
questions liées aux mésocentres,
- Pilotage de la structure par le `bureau du Groupe Calcul <{filename}presentation_groupe.rst#bureau>`_ regroupant
les bureaux du GdR et du réseau.
.. section:: Le réseau
:class: description
Le réseau Calcul a pour objectif de favoriser les échanges au sein de la communauté du calcul, dans tous les aspects
du métier, qu'ils soient scientifiques, techniques ou technologiques.
Notre axe stratégique consiste à accompagner la communauté dans le renforcement de ses compétences quant à :
- l'utilisation efficace des architectures de calcul par les applications scientifiques et les bibliothèques
logicielles pour exploiter au mieux les ressources et répondre aux besoins de la recherche ;
- la connaissance et l'usage expert des langages et bibliothèques logicielles pour développer ou sélectionner les
outils adaptés à un problème donné ;
- la culture approfondie des méthodes de calcul, de leur implémentation informatique et de leur validation pour
susciter de nouveaux développements au profit de la simulation numérique et de l'analyse des données réalisés dans
le cadre de travaux de recherche.
Contribuer à l'articulation de ces compétences dans nos métiers est une des vocations du réseau Calcul.
Cela nécessite un dialogue entre disciplines : les mathématiques appliquées, l'informatique et les sciences
applicatives (physique, biologie, etc.) et une exploration critique qui passe par des ateliers pratiques.
Les activités portées par le réseau favorisent la veille technologique, le retour d'expériences, la formation et
l'échange de pratiques entre les différents acteurs du calcul. Par leur portée trans-disciplinaires, elles
permettent aussi des regards croisés sur différentes applications du métier.
.. section:: Le groupement de recherche
:class: description
- Création d’un `Groupement De Recherche (GDR 3275) <presentation_gdr.html>`_ du CNRS rattaché à l'INSMI pour les aspects scientifiques du calcul (mathématiques appliquées et recherche en informatique)
- Création d’un `réseau métier <presentation_reseau.html>`_ rattaché à la `Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires (MITI) <http://www.cnrs.fr/mi/?lang=fr>`_ du CNRS pour les aspects technologiques (programmation, optimisation, architectures, ...)
- Partenariat avec `Grand Équipement National de Calcul Intensif (GENCI) <http://www.genci.fr/fr>`_ sur les aspects mésocentres.
- Pilotage de la structure par le `bureau du Groupe Calcul <membres_bureau.html>`_ regroupant les bureaux du GDR et du réseau
TODO
.. section:: Bureau
:class: orga
- Matthieu Boileau
- Anne Cadiou
- Cécile Cavet
- Roland Denis
- Thierry Dumont
- Bernard Dussoubs
- Benoit Fabrèges
- Alain Franc
- Loïc Gouarin
- Matthieu Haefele
- Florent Langrognet
- Violaine Louvet
- Marco Mancini
- Pierre Navaro
- Fabrice Roy
- Laurent Series
Présentation du |_| réseau Calcul
#################################
:date: 2019-03-13
:modified: 2019-03-13
:slug: presentation_reseau
.. contents::
.. section:: Le réseau
:class: description
Le réseau Calcul a pour objectif de favoriser les échanges au sein de la communauté du calcul, dans tous les aspects du métier, qu'ils soient scientifiques, techniques ou technologiques.
Notre axe stratégique consiste à accompagner la communauté dans le renforcement de ses compétences quant à
- l'utilisation efficace des architectures de calcul par les applications scientifiques et les bibliothèques logicielles pour exploiter au mieux les ressources et répondre aux besoins de la recherche ;
- la connaissance et l'usage expert des langages et bibliothèques logicielles pour développer ou sélectionner les outils adaptés à un problème donné ;
- la culture approfondie des méthodes de calcul, de leur implémentation informatique et de leur validation pour susciter de nouveaux développements au profit de la simulation numérique et de l'analyse des données réalisés dans le cadre de travaux de recherche.
Contribuer à l'articulation de ces compétences dans nos métiers est une des vocations du réseau Calcul.
Cela nécessite un dialogue entre disciplines : les mathématiques appliquées, l'informatique et les sciences applicatives (physique, biologie, etc.) et une exploration critique qui passe par des ateliers pratiques.
Les activités portées par le réseau favorisent la veille technologique, le retour d'expériences, la formation et l'échange de pratiques entre les différents acteurs du calcul. Par leur portée trans-disciplinaires, elles permettent aussi des regards croisés sur différentes applications du métier.
......@@ -49,10 +49,20 @@ MARKUP = ('md', 'ipynb')
PLUGIN_PATHS = ['./plugins']
PLUGINS = ['ipynb.markup', 'pelican_dynamic', 'rst_directives', 'extract_toc', 'calcul_reader', 'calcul_filters',
'rst_include', 'sitemap']
'rst_include', 'sitemap', 'pelican-deadlinks']
# Useful for 'rst_include' plugin (elative to content directory)
RST_GLOBAL_INCLUDES = ['../plugins/rst_include/include.rst']
# For pelican-deadlinks plugin
DEADLINK_VALIDATION = False
DEADLINK_OPTS = {
'archive': True,
'classes': ['custom-class1', 'disabled'],
'labels': True,
'timeout_duration_ms': 1000,
'timeout_is_error': False,
}
MENUITEMS = [('Le groupe', '/pages/presentation_groupe.html'),
('Paysage du calcul', '/pages/paysage_du_calcul.html'),
('Nos journées', '/category/journee.html'),
......
# Byte-compiled / optimized / DLL files
__pycache__/
*.py[cod]
*$py.class
# C extensions
*.so
# Distribution / packaging
.Python
env/
build/
develop-eggs/
dist/
downloads/
eggs/
.eggs/
lib/
lib64/
parts/
sdist/
var/
*.egg-info/
.installed.cfg
*.egg
# PyInstaller
# Usually these files are written by a python script from a template
# before PyInstaller builds the exe, so as to inject date/other infos into it.
*.manifest
*.spec
# Installer logs
pip-log.txt
pip-delete-this-directory.txt
# Unit test / coverage reports
htmlcov/
.tox/
.coverage
.coverage.*
.cache
nosetests.xml
coverage.xml
*,cover
.hypothesis/
# Translations
*.mo
*.pot
# Django stuff:
*.log
local_settings.py
# Flask stuff:
instance/
.webassets-cache
# Scrapy stuff:
.scrapy
# Sphinx documentation
docs/_build/
# PyBuilder
target/
# IPython Notebook
.ipynb_checkpoints
# pyenv
.python-version
# celery beat schedule file
celerybeat-schedule
# dotenv
.env
# virtualenv
.venv/
venv/
ENV/
# Spyder project settings
.spyderproject
# Rope project settings
.ropeproject
*.swp
*.orig
MIT License
Copyright (c) 2016 Marcin Glinski
Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
in the Software without restriction, including without limitation the rights
to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
furnished to do so, subject to the following conditions:
The above copyright notice and this permission notice shall be included in all
copies or substantial portions of the Software.
THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE
SOFTWARE.
# Dead Links
This plugin scans for links and checks status code of requested url.
For responses such as 403 or 404, the plugin adds a "disabled" class
to the anchor, extends anchor with a span label and dumps warning to
the logger.
# Requirements
BeautifulSoup4, requests
To install them using pip, type: `pip install bs4 requests`
# Installation
Clone repository somewhere (let's assume destination is ./plugins/custom/deadlinks)
and edit configuration file:
```python
PLUGINS_PATH = [
# [...]
'plugins/custom'
]
PLUGINS = [
# [...]
'deadlinks'
]
```
# Settings
To enable dead link checker, set the `DEADLINK_VALIDATION` option in your
Pelican configuration file to True.
Additionally following options might be changed:
```python
DEADLINK_OPTS = {
'archive': True,
'classes': ['custom-class1', 'disabled'],
'labels': True,
'timeout_duration_ms': 1000,
'timeout_is_error': False,
}
```
Options:
| Name | Description | Default value |
| ------ | ----------- | ------------- |
| `archive` | True/False. When enabled invalid links will be replaced with proper archive.org entry | True |
| `classes` | List of classes to be add to anchor element | Empty list |
| `labels` | Insert bootstrap's label after the anchor element | False |
| `timeout_duration_ms` | Time in ms after which request is considered as timed out | 1000 |
| `timeout_is_error` | True/False. When enabled every time out is considered as dead link | False |
# -*- coding: utf8 -*-
from .deadlinks import *
# -*- coding: utf8 -*-
from logging import info, debug, warn
from bs4 import BeautifulSoup
from pelican import signals
import requests
from requests.exceptions import Timeout, RequestException
UNKNOWN = None
MS_IN_SECOND = 1000.0
DEFAULT_OPTS = {
'archive': True,
'classes': [],
'labels': False,
'timeout_duration_ms': 1000,
'timeout_is_error': False,
}
SPAN_WARNING = u'<span class="label label-warning"></span>'
SPAN_DANGER = u'<span class="label label-danger"></span>'
ARCHIVE_URL = u'http://web.archive.org/web/*/{url}'
def get_status_code(url, opts):
"""
Open connection to the given url and check status code.
:param url: URL of the website to be checked
:return: (availibility, success, HTTP code)
"""
availibility, success, code = (False, False, None)
timeout_duration_seconds = get_opt(opts, 'timeout_duration_ms') / MS_IN_SECOND
try:
r = requests.get(url, timeout=timeout_duration_seconds)
code = r.status_code
availibility = True
success = code == requests.codes.ok
except Timeout:
availibility = False
success = UNKNOWN
except RequestException:
availibility = UNKNOWN
success = False
return (availibility, success, code)
def user_enabled(inst, opt):
"""
Check whether the option is enabled.
:param inst: instance from content object init
:param url: Option to be checked
:return: True if enabled, False if disabled or non present
"""
return opt in inst.settings and inst.settings[opt]
def get_opt(opts, name):
"""
Get value of the given option
:param opts: Table with options
:param name: Name of option
:return: Option of a given name from given table or default value
"""
return opts[name] if name in opts else DEFAULT_OPTS[name]
def add_class(node, name):
"""
Add class value to a given tag
:param node: HTML tag
:param name: class attribute value to add
"""
node['class'] = node.get('class', []) + [name, ]
def change_to_archive(anchor):
"""
Modify href attribute to point to archive.org instead of url directly.
"""
src = anchor['href']
dst = ARCHIVE_URL.format(url=src)
anchor['href'] = dst
def on_connection_error(anchor, opts):
"""
Called on connection error (URLError being thrown)
:param anchor: Anchor element (<a/>)
:param opts: Dict with user options
"""
classes = get_opt(opts, 'classes')
for cls in classes:
add_class(anchor, cls)
labels = get_opt(opts, 'labels')
if labels:
soup = BeautifulSoup(SPAN_DANGER, 'html.parser')
soup.span.append('not available')
idx = anchor.parent.contents.index(anchor) + 1
anchor.parent.insert(idx, soup)
archive = get_opt(opts, 'archive')
if archive:
change_to_archive(anchor)
def on_access_error(anchor, code, opts):
"""
Called on access error (such as 403, 404)
:param anchor: Anchor element (<a/>)
:param code: Error code (403, 404, ...)
:param opts: Dict with user options
"""
classes = get_opt(opts, 'classes')
for cls in classes:
add_class(anchor, cls)
labels = get_opt(opts, 'labels')
if labels:
soup = BeautifulSoup(SPAN_WARNING, 'html.parser')
soup.span.append(str(code))
idx = anchor.parent.contents.index(anchor) + 1
anchor.parent.insert(idx, soup)
archive = get_opt(opts, 'archive')
if archive:
change_to_archive(anchor)
def content_object_init(instance):
"""
Pelican callback
"""
if instance._content is None:
return
if not user_enabled(instance, 'DEADLINK_VALIDATION'):
debug("Configured not to validate links")
return
settings = instance.settings
siteurl = settings.get('SITEURL', '')
opts = settings.get('DEADLINK_OPTS', DEFAULT_OPTS)
cache = {}
soup_doc = BeautifulSoup(instance._content, 'html.parser')
for anchor in soup_doc(['a', 'object']):
if 'href' not in anchor.attrs:
continue
url = anchor['href']
# local files and other links are not really intresting
if not url.startswith('http'):
continue
# Previous case works also for debugging environment (with SITEURL
# being empty) This case resolves publish environment with all links
# starting with http.
if siteurl and url.startswith(siteurl):
info("Url %s skipped because is starts with %s", url, siteurl)
continue
# No reason to query for the same link again
if url in cache:
avail, success, code = cache[url]
else: